Para ilmuwan telah mengidentifikasi gen manusia yang melawan infeksi SARS-CoV-2

Tampilan mikroskopis dari virus corona. Kredit: Yeti bertitik

Periksalah dengan tepat gen yang merangsang interferon yang mereka kendalikan SARS-CoV-2 replikasi.

Para ilmuwan di Sanford Burnham Prebys telah mengidentifikasi satu set gen manusia yang melawan infeksi SARS-CoV-2, virus yang menyebabkan COVID-19. Mengetahui gen mana yang membantu mengendalikan infeksi virus dapat sangat membantu para peneliti memahami faktor-faktor yang mempengaruhi tingkat keparahan penyakit, serta menyarankan kemungkinan pilihan terapeutik. Gen yang dimaksud terkait dengan interferon, yang melawan virus di bagian depan tubuh.

Studi tersebut dipublikasikan di jurnal Sel molekuler.

“Kami ingin mendapatkan pemahaman yang lebih baik tentang respons seluler terhadap SARS-CoV-2, termasuk apa yang menyebabkan respons kuat atau lemah terhadap infeksi,” kata Dr. Sumit K. Chanda, profesor dan direktur imunitas dan patogenesis. Program di Sanford Burnham Prebys dan penulis utama studi ini. “Kami telah memperoleh wawasan baru tentang bagaimana virus mengeksploitasi sel manusia yang diserang, tetapi kami masih mencari kelemahan sehingga kami dapat mengembangkan antivirus yang optimal.”

Tak lama setelah timbulnya pandemi, dokter menemukan bahwa respons interferon yang lemah terhadap infeksi SARS-CoV-2 menyebabkan beberapa kasus COVID-19 yang lebih parah. Pengetahuan ini membuat Chanda dan kolaboratornya mencari gen manusia yang dipicu oleh interferon, yang dikenal sebagai gen yang distimulasi interferon (ISG), yang bertindak untuk membatasi infeksi SARS-CoV-2.

Berdasarkan pengetahuan yang diperoleh dari SARS-CoV-1, virus yang menyebabkan wabah penyakit yang mematikan tetapi relatif singkat dari tahun 2002 hingga 2004 dan mengetahui bahwa itu mirip dengan SARS-CoV-2, para peneliti dapat mengembangkan eksperimen laboratorium. untuk mengidentifikasi ISG yang mengontrol replikasi virus di COVID-19.

“Kami menemukan bahwa 65 ISG yang dikendalikan untuk infeksi SARS-CoV-2, termasuk beberapa yang menghambat kemampuan virus untuk memasuki sel, beberapa yang menekan produksi virus. RNA itu adalah darah vital virus dan sekelompok gen yang menghambat perakitan virus, ”kata Chanda. “Yang juga menarik adalah fakta bahwa beberapa ISG menunjukkan kendali atas virus yang tidak terkait, seperti flu musiman, West Nile dan HIV, yang menyebabkan AIDS.”

“Kami mengidentifikasi delapan ISG yang menghambat replikasi SARS-CoV-1 dan CoV-2 di kompartemen subseluler yang bertanggung jawab atas pengemasan protein, menunjukkan bahwa situs yang rentan ini dapat digunakan untuk membersihkan infeksi virus,” kata Dr. Laura Martin-Sancho. , seorang rekan postdoctoral senior di Laboratorium Chanda dan penulis pertama studi ini. “Ini adalah informasi penting, tetapi kami masih perlu mempelajari lebih lanjut tentang biologi virus dan melihat apakah variabilitas genetik dalam ISG ini berkorelasi dengan tingkat keparahan COVID-19.”

Sebagai langkah selanjutnya, peneliti akan mencermati biologi varian SARS-CoV-2 yang terus berkembang dan mengancam keampuhan vaksin. Martin-Sancho mencatat bahwa mereka sudah mulai mengumpulkan varian untuk pengujian laboratorium,

“Sangat penting bahwa kita tidak melepaskan diri dari upaya penelitian besar sekarang karena vaksin membantu mengendalikan pandemi,” simpul Chanda. “Kami sampai di sana begitu cepat karena kami berinvestasi dalam penelitian dasar di Sanford Burnham Prebis dan di tempat lain, dan upaya berkelanjutan kami akan sangat penting ketika, bukan jika, wabah virus lain terjadi.”

Referensi: “Lanskap Fungsional Batasan Sel SARS-CoV-2” oleh Laura Martin-Sancho, Mary K. Lewinski, Lars Pache, Charlotte A. Stoneham, Xin Yin, Mark E. Becker, Dexter Pratt, Christopher Churas, Sara B Rosenthal , Sophie Liu, Stuart Weston, Paul D. De Jesus, Alan M. O’Neill, Anshu P. Gounder, Courtney Nguyen, Yuan Pu, Heather M. Curry, Aaron L. Oom, Lisa Miorin, Ariel Rodriguez-Frandsen, Feng Zheng, Chongxiang Wu, Yong Xiong, Matthew Urbanowski, Megan L.Shaw, Max W. Chang, Christopher Benner, Thomas J. Harapan, Matthew B.Freeman, Adolfo Garcia-Sastre, Trey Ideker, Judd F. Hulqvist, John Guateli dan Sumit K. Chanda, 13 April 2021, Sel molekuler.
DOI: 10.1016 / j.molcel.2021.04.008

Penulis studi tambahan termasuk Lars Pache, Anshu P. Gonder, Courtney Nguyen, Yuan Pu, Heather M. Curry, Paul D. De Jesus, Ariel Rodriguez-Frandsen, dan Sin Yin dari Sanford Burnham Prebys. Penulis lain termasuk Mary K. Lewinsky, Charlotte A. Stoneham, Aaron L. Oum, dan John Guateli dari Universitas California, San Diego, dan Sistem Kesehatan San Diego; Mark Becker, Thomas J. Harapan dan Judd F. Hulkvist c Universitas Northwestern Sekolah Kedokteran Feinberg; Dexter Pratt, Christopher Churas, Sara B. Rosenthal, Sophie Liu, Fan Zheng, Max W. Chang, Christopher Benner, Trey Ideker, dan Alan M. O’Neill dari Universitas California, San Diego; Lisa Miorin, Matthew Urbanowski, Megan L. Shaw dan Adolfo Garcia-Sastre di Ican Medical School di Mount Sinai; Stuart Weston dan Matthew B. Freeman dari Fakultas Kedokteran Universitas Maryland; dan Chunxiang Wu dan Yong Xiong Universitas Yale.

Penelitian ini didukung oleh hibah DoD W81XWH-20-1-0270; DHIPC: U19 AI118610; dan Fluomics / NOSI: U19 AI135972. Itu juga didukung oleh sumbangan amal murah hati dari Dina Roach dan Susan dan James Blair, Yayasan JPB, Proyek Filantropi Terbuka (hibah penelitian 2020-215611 (5384)) dan donor anonim. Dukungan tambahan disediakan oleh DARPA grant HR0011-19-2-0020 dan CRIP (Center for Influenza Pathogenesis), didanai oleh NIAID Center for Excellence in Influenza Research and Monitoring (CEIRS, kontrak № HHSN272201400008C). Pekerjaan ini selanjutnya didukung oleh hibah berikut untuk Fakultas Kedokteran Universitas Northwestern di Feinberg: Suplemen CTSA untuk NCATS: UL1 TR002389; Suplemen CTSA untuk NUCATS dengan dukungan murah hati dari keluarga Dixon: UL1 TR001422; dan melengkapi Cancer Center: P30 CA060553. Dukungan tambahan diberikan oleh hibah berikut kepada JG di UC San Diego: hibah dari NIH R37AI081668. Pekerjaan ini didukung oleh hibah yang murah hati dari James B. Pendleton Charitable Trust.

Related articles

Comments

LEAVE A REPLY

Please enter your comment!
Please enter your name here

Share article

Latest articles

Alat-alat baru dibutuhkan untuk mencegah pandemi penyakit tanaman

Mengamati penyakit tanaman dapat mengungkapkan keamanan pangan. Penyakit tanaman tidak berhenti di perbatasan negara, dan kilometer lautan juga tidak mencegah penyebarannya. Itulah mengapa pengawasan...

Ilmuwan Menjelajahi Tesla Roads Jangan Ambil – Dan Temukan Kekuatan Baru Berguna dalam Penemuan Centennial

Foto eksposur ganda Nikola Tesla pada bulan Desember 1899 duduk di laboratoriumnya di Colorado Springs di sebelah kaca pembesar generator tegangan tinggi sementara mesin...

Untuk Mempercepat Akses, Mikroskopi yang Sangat Dapat Diputar Meninggalkan “Di Bawah Kisi”

Contoh desain ubin yang digunakan pada ulat percobaan C. elegans. Mesin non-grid memberi model fleksibilitas sementara untuk dengan cepat memasuki lingkungan yang menyenangkan....

Lingkar Kuno Munculnya Tektonik Lempeng Data 3,6 Miliar Tahun Lalu – Peristiwa Penting untuk Memperkaya Kehidupan Bumi

Zirkonia yang dipelajari oleh tim peneliti, difoto menggunakan katodoluminesensi, memungkinkan tim untuk melihat bagian dalam kristal menggunakan mikroskop elektron khusus. Lingkar zirkon adalah...

Bisakah kita mengurangi kecanduan opioid? [Video]

Pada 2017, jutaan orang di seluruh dunia kecanduan opioid dan 115.000 meninggal karena overdosis. Opioid adalah obat penghilang rasa sakit paling manjur yang kita miliki,...

Newsletter

Subscribe to stay updated.