The Translational Genomics Research Institute (TGen), anak perusahaan City of Hope, telah mengidentifikasi target genetik tertentu yang dapat membantu menjelaskan variasi yang sangat besar dalam berapa banyak pasien yang terinfeksi. COVID-19 harus dilakukan.
Hasil studi yang dipublikasikan baru-baru ini di jurnal mSphere, gambarkan molekul yang terbuat dari DNA – miR1307 – sebagai sakelar dimer potensial yang dapat memengaruhi tingkat keparahan penyakit; mengapa beberapa terinfeksi SARS-CoV-2, virus penyebab COVID-19, memiliki gejala ringan atau tidak ada gejala, sementara yang lain menjadi sakit parah atau meninggal.
Dipimpin oleh Dr.Nicholas Shork, seorang profesor yang dihormati dan direktur Departemen Pengobatan Kuantitatif dan Biologi Sistem TGen, para peneliti mengidentifikasi miR1307 dengan membandingkan elemen genetik SARS-Cov-2 dengan tujuh virus korona manusia lainnya, beberapa di antaranya hanya menyebabkan flu biasa. . Mereka juga mempelajari genom strain virus korona yang diketahui menginfeksi kelelawar, babi, trenggiling, musang, musang dan ayam.
“Kami melakukan analisis komparatif gen-demi-gen yang sistematis untuk memeriksa bagaimana dan sejauh mana urutan genomik SARS-CoV-2 berbeda dari genom virus korona manusia dan hewan lainnya yang dikarakterisasi dengan baik,” kata Dr. Shork. “Hasil penelitian kami akan memungkinkan pengembangan model bagaimana virus dan inangnya berinteraksi, meningkatkan pemahaman kami tentang mekanisme patogenik SARS-CoV-2 dan cara mengeksploitasi target terapeutik virus dan inang.
Hasil penelitian menunjukkan bahwa miR1307 berfungsi sebagai sakelar yang menghidupkan atau mematikan berbagai gen virus, berpotensi membuat penyakit lebih atau kurang berbahaya bagi pasien dengan mengatur, misalnya, seberapa cepat atau lambat virus bereplikasi. Studi sebelumnya telah menemukan bahwa miR1307 mempengaruhi keparahan beberapa kanker, penyakit paru-paru dan influenza, khususnya virus influenza H1N1, yang menyebabkan pandemi pada tahun 2009. Ini pertama kali ditemukan sebagai agen pengatur utama di Epstein. Barr, paling dikenal sebagai penyebab infeksi mononukleosis.
Menurut Dr. Schork, hasil penelitian tersebut juga memberikan dasar untuk penelitian selanjutnya, seperti perancangan vaksin berbasis protein atau RNA, pengembangan penanda genetik khusus untuk pemantauan penyakit komunitas dan penelusuran COVID-19 dari satu spesies ke spesies lainnya.
Referensi: “Terminal genomik SARS-CoV-2 yang diawetkan sebagai elemen fungsional koevolusi dan target terapi potensial” oleh mSphere.
DOI: 10.1128 / mSphere.00754-20
Pendanaan untuk penelitian ini disediakan oleh National Science Foundation (hibah RAPID # 2031819). Infrastruktur komputasi disediakan oleh Dell Technologies.